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Article by Xavier Lafargue, TdG.
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Etude de la structure génétique du panicaut des Alpes
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Etude de la structure génétique du panicaut des Alpes, Eryngium alpinum

Structuration et recolonisation post-glaciaire du panicaut des Alpes, Eryngium alpinum.

eryngiumloupe   eryngiumloupe

Intervenants: Yamama Naciri

Le panicaut des Alpes (chardon bleu) est une apiacée hémicryptophyte pluriannuelle de l'étage subalpin, de distribution alpine et illyrique. Cette espèce est protégée aussi bien en Suisse que dans toute l'Europe en raison de son attractivité (cueillette, commercialisation, culture) et de la diminution constante de ses stations. En Suisse, elle est répartie dans plusieurs stations des Alpes, principalement dans les Préalpes vaudoises et fribourgeoises mais également dans les Alpes valaisannes et grisonnes. Cultivé dans les jardins et les rocailles, le chardon bleu s'est souvent échappé de culture. Il a aussi été introduit volontairement par des amateurs dans plusieurs stations des Préalpes ou du Jura.

Le but du projet est d'étudier la structuration génétique du panicaut des Alpes à l'aide de marqueurs chloroplastiques et de marqueurs nucléaires microsatellites (Gaudeul et al., 2002 ; 2004). Les résultats obtenus à l’aide des microsatellites montrent que la régression de cette espèce en Suisse n’est vraisemblablement pas due à de la consanguinité. La phylogéographie de l'espèce, reconstruite sur la zone alpine à l’aide des deux marqueurs chloroplastiques psbA-trnH et trnS-trnG, révèle l’existence de six lignages correspondant sans doute à deux refuges quaternaires principaux, l’un dans le sud-ouest de l’arc alpin, l’autre dans les Balkans (Naciri et Gaudeul, 2007).

L’ensemble des résultats obtenus sur les deux types de marqueurs permet d’identifier les populations ou les régions devant être particulièrement protégées (Naciri et Lambelet, 2007; 2011).

Collaboration: Dr M. Gaudeul, Laboratoire d’Ecologie Alpin de l’Université de Grenoble, Département Systématique et Evolution du Muséum d’Histoire Naturelle de Paris.

Financement: Société Suisse de Botanique, Société Académique de Genève

Lien: Conservation

Publications scientifiques:

GAUDEUL M., BARJON, F., TILL-BOTTRAUD, I. & MANEL S. (2004). Genetic diversity and differentiation in Eryngium alpinum L. (Apiaceae): Comparison of AFLP and microsatellite markers. Heredity, 92: 508-518.
GAUDEUL M., NACIRI-GRAVEN Y., GAUTHIER P. & POMPANON F. (2002). Isolation and characterization of microsatellite markers in a perennial Apiaceae, Eryngium alpinum L. Molecular Ecology Notes, 2: 107-109.
NACIRI Y. & GAUDEUL M. (2007). Phylogeography of the endangered Eryngium alpinum L. (Apiaceae), in the European Alps. Molecular Ecology, 16: 2721-2733.
NACIRI Y. & MANEN J.-F. (2010). Potential transfer from the chloroplast to the nuclear (NuPt) in Eryngium alpinum L. (Apiaceae). Molecular Ecology Resources, 10: 728-731.

Communications scientifiques

NACIRI - GRAVEN Y. & GAUDEUL M. (2003). The Ice Age legacy in the Alps: the phylogeography of Eryngium alpinum an endangered alpine plant. Biology03, 13-14 February 2003, University of Zürich, Switzerland.
NACIRI Y. (2009). Colonisation, différentiation et adaptation: Quand l'ADN nous parle de temps et d'espace ou l'outil que Darwin aurait bien aimé avoir. Evolution et Biodiversité, 5-7 novembre 2009, Sion, Switzerland.
NACIRI Y. (2009). When DNA speaks about time and space: Alpine history and conservation. The case of Eryngium alpinum. Seminars of the Botanical Institute, 11 mai 2009, Zurich, Switzerland.
NACIRI Y. (2009). Genetic markers: what use for conservation ? Examples with Eryngium alpinum and Littorella uniflora. Lecture Series in Plant and Animal Conservation Ecology, 26 November 2009, Berne, Switzerland.

Posters:

NACIRI Y. & LAMBELET C. (2008). La conservation du panicaut des Alpes, Eryngium alpinum: apport de la génétique. Biodiversité en Valais. 6-8 novembre 2008, Sion, Switzerland.
NACIRI Y., GAUDEUL M., TILL-BOTTRAUD I. & LAMBELET C. (2009). The past and present history of an alpine endangered plant, Eryngium alpinum (Apiaceae): insights from phylogeography and population genetics. ECCB 2009, 1-5 September, Prague.
NACIRI Y. (2011). Evidence of DNA transfer from the chloroplast to the nucleus (NuCp) in Eryngium alpinum: implication for molecular studies. Plant Genome Evolution, 4-6 September, Amsterdam, the Netherlands.

Vulgarisation scientifique:

NACIRI Y. (2007). Etude de la diversité et de la structure génétique du panicaut des Alpes Eryngium alpinum en Suisse. 3ème Circulaire de la Société Suisse de Botanique, 11-13.
NACIRI Y. & LAMBELET C. (2007). L’utilisation des marqueurs génétiques pour le suivi des espèces en danger: l’exemple du Panicaut des Alpes, Eryngium alpinum. Feuille Verte, 37: 15-16.
NACIRI Y. & LAMBELET C. (2011) Le chardon bleu Eryngium alpinum en Valais: diversité génétique et conservation. La Murithienne, 128: 65-71.